本書為美國(guó)冷泉港實(shí)驗(yàn)室蛋白質(zhì)組學(xué)課程培訓(xùn)用書,為蛋白質(zhì)組學(xué)工作者案頭必備實(shí)驗(yàn)手冊(cè)。內(nèi)容涉及各種蛋白質(zhì)制備和分離方法、質(zhì)譜分析的一般方法、用于蛋白質(zhì)表達(dá)的編碼序列的高通量克隆、蛋白質(zhì)芯片的制備和使用以及驗(yàn)證這些數(shù)據(jù)的分析方法等內(nèi)容。書中附有大量的以step-by-step形式展現(xiàn)的操作程序,針對(duì)關(guān)鍵性步驟增加說明性文字加以點(diǎn)撥,并有信息框闡述關(guān)鍵的知識(shí)點(diǎn),具有很強(qiáng)的實(shí)用性和可操作性。本書適用于生物、醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)和藥學(xué)等專業(yè)研究生、高年級(jí)本科生和相關(guān)研究人員查閱參考。
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簡(jiǎn)介1實(shí)驗(yàn)1全細(xì)胞裂解物的雙向凝膠電泳和MALDI 質(zhì)譜分析
操作程序1.1酵母細(xì)胞裂解液的制備
操作程序1.2IPG膠條的再水化和等電聚焦
操作程序1.3等電聚焦膠條的平衡
操作程序1.4第二向--SDS.PAGE
操作程序1.5用SYPRO Ruby進(jìn)行全蛋白染色
操作程序1.6用Pro.Q Diamond進(jìn)行磷酸化蛋白染色
操作程序1.7用Pro.Q Emerald進(jìn)行糖蛋白染色
操作程序1.8用考馬斯亮藍(lán)進(jìn)行全蛋白染色
操作程序1.9用質(zhì)譜兼容的銀染進(jìn)行全蛋白染色
操作程序1.102D膠的圖像分析和蛋白質(zhì)回收
操作程序1.11膠內(nèi)酶切
操作程序1.12MALDI點(diǎn)靶29實(shí)驗(yàn)2用于質(zhì)譜分析的蛋白質(zhì)復(fù)合物的純化
操作程序2.1培養(yǎng)并收集TAP標(biāo)記的酵母細(xì)胞
操作程序2.2為純化TAP標(biāo)記蛋白質(zhì)復(fù)合物制備酵母細(xì)胞抽提物
操作程序2.3及時(shí)步親和富集--利用IgG親和色譜從酵母抽提物中捕獲TAP標(biāo)記的蛋白質(zhì)復(fù)合物
操作程序2.4第二步親和富集--TAP.標(biāo)記的蛋白質(zhì)復(fù)合物的鈣調(diào)蛋白親和色譜
操作程序2.5與磁珠的結(jié)合
操作程序2.6蛋白質(zhì)復(fù)合物的親和純化
實(shí)驗(yàn)3用MALDI TOF/TOF串聯(lián)質(zhì)譜進(jìn)行肽的定性和定量分析
操作程序3.1實(shí)驗(yàn)描述
實(shí)驗(yàn)4蛋白質(zhì)復(fù)合物分析--高靈敏液相色譜與串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用
操作程序4.1HPLC柱毛細(xì)管的制作
操作程序4.2填裝微毛細(xì)管FSC柱
操作程序4.3微毛細(xì)管RP.HPLC與ESI.質(zhì)譜聯(lián)用
實(shí)驗(yàn)5用IMAC和質(zhì)譜分析磷酸化肽
操作程序5.1制備IMAC樣品
操作程序5.2制備IMAC柱和反相捕獲柱(前柱)
操作程序5.3制備IMAC柱
操作程序5.4樣品處理
實(shí)驗(yàn)6全細(xì)胞裂解物的多維蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)分析
操作程序6.1使用多維蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)分析全細(xì)胞裂解物
實(shí)驗(yàn)7全細(xì)胞提取物的定量質(zhì)譜檢測(cè)技術(shù)(iTRAQ)
操作程序7.1從酵母細(xì)胞制備肽
操作程序7.2以iTRAQ試劑標(biāo)記肽
操作程序7.3應(yīng)用反向色譜柱提純肽
操作程序7.4多肽等電聚焦95實(shí)驗(yàn)8串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)的分析及確認(rèn)
操作程序8.1使用Global Proteome Machine系統(tǒng)分析LC.MS/MS數(shù)據(jù)
操作程序8.2使用ProteinPilot軟件進(jìn)行肽段和蛋白質(zhì)鑒定
操作程序8.3對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索程序鑒定為能夠匹配肽段序列的MS/MS譜圖
進(jìn)行評(píng)價(jià)118實(shí)驗(yàn)9開放閱讀框的高通量克隆--構(gòu)建大量表達(dá)結(jié)構(gòu)
操作程序9.1利用Gateway LR反應(yīng)構(gòu)造表達(dá)結(jié)構(gòu)
操作程序9.2用Gateway LR反應(yīng)產(chǎn)物化學(xué)轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)菌
實(shí)驗(yàn)10蛋白質(zhì)微陣列的構(gòu)建--核酸可編程性蛋白質(zhì)陣列
操作程序10.1用氨基甲硅烷包被載玻片
操作程序10.2在96孔板中制備細(xì)菌的培養(yǎng)物
操作程序10.3從96孔板中分離質(zhì)粒DNA
操作程序10.4DNA的生物素化、沉淀及樣品布陣
操作程序10.5NAPPA載玻片上蛋白質(zhì)的表達(dá)
操作程序10.6檢測(cè)NAPPA載玻片上的蛋白質(zhì)
操作程序10.7在NAPPA芯片上測(cè)定DNA151
實(shí)驗(yàn)11使用核酸可編程性蛋白質(zhì)陣列鑒定蛋白質(zhì).蛋白質(zhì)相互作用
操作程序11.1NAPPA芯片與查詢蛋白共表達(dá)
操作程序11.2在NAPPA芯片上檢測(cè)查詢蛋白
附錄1鈉升電噴霧電離離子源和串聯(lián)質(zhì)譜裝置和示范
附錄2溶液內(nèi)蛋白質(zhì)的消化
附錄3凝膠內(nèi)胰酶消化已分離蛋白
附錄4三氯乙酸蛋白質(zhì)沉淀法
附錄5氨基酸的單同位素和亞銨離子分子量
附錄6氨基酸二肽分子量
附錄7LTQ離子阱的使用方法
附錄8肽段混合物離線去鹽
附錄9感受態(tài)細(xì)胞的制備
附錄10DNA的定量
附錄11注意事項(xiàng)
索引
內(nèi)容詳細(xì),過程簡(jiǎn)單。分析說理透徹。
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從事蛋白質(zhì)組學(xué)研究必不可少的工具書
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當(dāng)作實(shí)驗(yàn)操作教程來用
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這本書里面非常簡(jiǎn)略,倒是有照片等演示某些操作要領(lǐng)。其實(shí)在網(wǎng)絡(luò)上有可以下到英文版的,只是非常分散而已。內(nèi)容較深一些,適合于特別熟悉這個(gè)領(lǐng)域的工作者,對(duì)于初學(xué)者來說則不是太合適。例如,itraq一開始就來的很專業(yè),極為簡(jiǎn)練,對(duì)于剛了解這個(gè)的人來說難度過大。推薦給極為專業(yè)的人士
是關(guān)于蛋白質(zhì)組學(xué)的實(shí)驗(yàn)方法學(xué)的指導(dǎo)書,內(nèi)容比較全面