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及時篇 概述

第1章 介紹：什么是基因表達？

1.1 分子生物學的中心法則

1.2 基因轉錄的復雜性

1.3 轉錄調控元件

1.4 染色質活動在基因調控中的作用

1.5 基因表達程序

1.6 主要概念

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第2章 染色質的功能

2.1 常染色質和異染色質

2.2 核小體

2.3 染色質開放和封閉時的組蛋白修飾

2.4 組蛋白修飾的基因組效應

2.5 染色質結構

2.6 表觀遺傳信號對健康和疾病的影響

2.7 主要概念

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第二篇 轉錄因子篇

第3章 基礎轉錄機器

3.1 核心啟動子

3.2 TATA框

3.3 核心啟動子元件

3.4 TFⅡD作為多蛋白復合物的范例

3.5 基因組范圍內識別核心啟動子的方法

3.6 中介復合物

3.7 主要概念

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第4章 轉錄因子

4.1 位點特異性轉錄因子

4.2 轉錄因子結構域

4.3 二聚體化的轉錄因子復合物：核受體異源二聚體的例子

4.4 生物信息學方法識別轉錄因子結合位點

4.5 轉錄因子表達譜

4.6 轉錄因子的分類

4.7 主要概念

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第5章 信號轉導與基因調控

5.1 潛在轉錄因子的激活

5.2 轉錄因子網絡

5.3 轉錄因子調控的程序性細胞分化

5.4 NFKB信號途徑

5.5 炎癥反應中的轉錄因子

5.6 感應細胞壓力：p53途徑

5.7 主要概念

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第6章 基因表達開關：核受體的例子

6.1 核受體超家族

6.2 核受體的分子間相互作用

6.3 核受體的生理作用

6.4 核受體及其配體

6.5 核受體和輔因子的相互作用

6.6 主要概念

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第7章 基因組作圖

7.1 進化足跡法

7.2 ENCODE計劃

7.3 ENCODE計劃的數據挖掘

7.4 整合ChIP-seq數據

7.5 轉錄因子的其他DNA結合模式

7.6 轉錄因子與靶基因的匹配

7.7 主要概念

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第三篇 染色質篇

第8章 染色質修飾因子

8.1 組蛋白密碼模型

8.2 組蛋白修飾酶

8.3 組蛋白標記的全基因組分析和它們的修飾酶

8.4 染色質修飾和疾病

8.5 主要概念

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第9章 基因組印記

9.1 絕緣子

9.2 基因組調節CTCF

9.3 基因組印記

9.4 絕緣子功能模型

9.5 CTCF介導的染色質結構的遺傳

9.6 主要概念

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第10章 表觀基因組

10.1 DNA甲基化

10.2 基因組范圍的DNA甲基化

10.3 DNA甲基化、異染色質和基因沉默

10.4 健康與疾病中的表觀基因組學

10.5 主要概念

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第11章 染色質重塑

11.1 染色質重塑的作用

11.2 ATP-依賴的重塑復合物

11.3 啟動子上的核小體定位

11.4 先鋒因子

11.5 轉錄動力學和噪聲

11.6 主要概念

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第12章 染色質結構

12.1 細胞核的組織

12.2 高級DNA環結構的形成

12.3 細胞核內的分區

12.4 轉錄工廠

12.5 核定位與疾病

12.6 主要概念

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第四篇 非編碼RNA篇

第13章 調控RNA

13.1 非編碼RNAs

13.2 miRNA及其功能

13.3 長鏈非編碼RNA

13.4 eRNA

13.5 miRNA和轉錄因子介導的基因調控

13.6 主要概念

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