本書回顧了理論與計算化學發展的歷程,揭示了學科交叉的重要性以及化學理論的發展對整個化學進步的巨大推動作用;分析了國內外現狀和發展趨勢,展望了前景和面臨的難題。提出了發展思路和戰略性措施,建議促進學科發展的資助機制與政策。對學科涵蓋的電子結構理論與計算方法、化學中的統計力學、微觀反應機理和反應動態學、材料科學中的問題、生命科學與藥物化學中的問題五個專題中的關鍵科學問題和重要前沿研究方向進行了深入探索和討論。
本書可供高層次管理專家做戰略決策時參考,也可供研究生和有關科研人員閱讀,有助于深化對學科發展趨勢、發展前景的認識以及了解關鍵科學問題和前沿領域的重點方向。
學科發展戰略研究工作沿襲了由中科院院士牽頭的方式,并凝聚相關領域專家學者共同開展研究。他們秉承“知行合一”的理念,將深刻的洞察力和嚴謹的工作作風結合起來,潛心研究,求真唯實,“知之真切篤實處即是行,行之明覺精察處即是知”。他們精益求精,“止于至善”,“皆當至于至善之地而不遷”,力求盡善盡美,以獲取集體智慧。他們在中國基礎研究從與發達國家“總量并行”到“貢獻并行”再到“源頭并行”的升級發展過程中,腳踏實地,拾級而上,縱觀全局,極目迥望。他們站在巨人肩上,立于科學前沿,為中國乃至世界的學科發展指出可能的生長點和新方向。
本書由國家自然科學基金委員會與中國科學院聯合。項目主持人為北京大學黎樂民院士。黎樂民院士現任北京大學化學與分子工程學院教授、博士生導師、院學術委員會主任、理學部和校學術委員會委員;兼任《稀土材料化學及應用》國家重點實驗室學術委員會主任、《理論與計算化學》國家重點實驗室學術委員會主任、《中國科學》(B輯:化學)執行副主編、《高等學校化學學報》副主編、《中國化學快報》副主編等學術職務。
總序
前
摘要
Abstract
總論 理論與計算化學發展戰略縱覽
節 理論與計算化學在基礎科學中的地位
第二節 學科內涵、發展歷程與規律
第三節 學科發展現狀與發展態勢
第四節 發展戰略思路
第五節 發展方向:關鍵科學問題和學科重要研究前沿
第六節 資助機制與政策建議
第七節 小結
篇 電子結構理論與計算方法
章 電子結構理論與計算方法概述
第二章 波函數電子相關方法的進展及展望
節 引
第二節 多組態自洽場方法和組態相互作用方法
第三節 耦合簇方法
第四節 顯式相關方法
第五節 未來的發展方向
第三章 量子化學中的密度矩陣重整化群方法
節 引
第二節 DMRG傳統的形式和語
第三節 矩陣乘積態
第四節 算法中的微擾修正和noise的加入
第五節 對稱性的問題
第六節 激發態的問題
第七節 DMRG在量子化學中的新發展
第八節 總結和展望
第四章 價鍵理論方法
節 引
第二節 從頭算價鍵理論方法進展
第三節 價鍵理論方法關鍵問題
第五章 微擾理論的發展現狀及展望
節 引
第二節 單參考態微擾理論
第三節 多參考態微擾理論
第四節 顯含r12的微擾理論
第五節 Monte Carlo方法在微擾理論中的應用
第六節 總結
第七節展望
第六章 密度泛函理論基礎進展及其與多體理論的關系
節 引
第二節 發展現狀綜述和評價
第七章 近似密度泛函的發展
節 主要科學問題
第二節 現有近似泛函的大致分類
第三節 近似泛函的系統評測
第四節 近似泛函的重要誤差來源
第五節 亟待解決的重大問題
第六節 可能解決問題的途徑
第七節 20篇標志性論文
第八章TDDFT的發展與在激發態計算和開放體系中的應用
節 引
第二節 歷史與現狀
第三節 展望與建議
第九章 多體格林函數方法
節 引
第二節 理論框架
第三節 發展歷程
第四節 發展趨勢
第十章 強關聯材料的性原理電子結構理論
節 引
第二節 基于對LDA/GGA修正的性原理方法
第三節 基于格林函數的性原理多體理論方法
第四節 結合模型哈密頓量的性原理方法
第五節 總結與展望
第十一章 相對論分子量子力學中的若干基本問題與解決方案
節 引
第二節 相對論哈密頓
第三節 相對論電子相關
第四節 相對論電子性質
第五節 結論與展望
第十二章 量子蒙特卡羅方法
節 引
第二節 變分蒙特卡羅方法
第三節 實幾何空間格林函數蒙特卡羅方法
第四節 反對稱組態空間蒙特卡羅方法
第五節 蒙特卡羅方法中的激發態計算問題
第六節 含時量子蒙特卡羅方法
第七節 減少QMC計算誤差的算法
第八節 總結與展望
第十三章 約化密度矩陣理論
節 引
第二節 二階約化密度矩陣理論
第三節 一階密度矩陣泛函理論
第四節 總結
第十四章 超大體系的處理方法
節 引
第二節 大體系的量子化學計算方法
第三節 超大體系的處理方法簡述
第四節 結論和展望
第二篇 化學中的統計力學
章 化學中的統計力學概述
節 歷史簡介
第二節 近20年重要進展及展望
第二章 統計力學基礎與漲落定理
節 引
第二節 量子統計力學
第三節 漲落定理的相關研究進展
第四節 展望
第三章 凝聚相量子動力學
節 引
第二節 理論方法的主要進展
第三節 總結與展望
第四章 復雜分子體系電子激發態動力學理論方法
節 引
第二節 理論方法的主要進展
第三節 總結與展望
第五章 數值路徑積分方法展望
節 引
第二節 虛時間路徑積分:路徑積分分子動力學/蒙特卡羅平衡統計方法
第三節 基于路徑積分的實時間動力學方法
第四節 總結和展望
第六章 增強抽樣
節 引
第二節 分子模擬研究存在的主要科學問題及增強抽樣方法的發展
第三節 展望
第四節 小結
第七章 粗粒化理論思想
節 引
第二節 粗粒化方法發展歷史、現狀及挑戰
第三節 展望
第八章 高分子統計理論與數值模擬
節 引
第二節 高分子統計理論與數值模擬的現狀與挑戰
第三節 展望
第九章 生物分子統計模擬方法
節 引
第二節 生物分子統計模擬方法的發展介紹
第三節 展望
第三篇 微觀反應機理和反應動態學
章 微觀反應機理和反應動態學概述
第二章 氣相小分子體系量子動力學
——氣相小分子體系量子動力學研究的突破性進展、面臨的問題和展望
節 引
第二節 發展歷史和現狀
第三節 展望
第三章 光化學反應機理和動力學
節 引
第二節 歷史和現狀
第三節 展望:未來重要發展方向和重點研究的科學問題
第四章 熱化學反應機理:氣相和溶液中典型化學反應機理
——突破性進展、目前和未來要解決的重大問題和一些思路
節 引
第二節 研究現狀和面臨挑戰及相關重要進展
第三節 展望
第五章 多相催化理論研究進展
節 引
第二節 發展歷史和現狀
第三節 展望
第六章 光催化反應及相關理論與計算研究
節 引
第二節 拓展光催化材料的光譜響應范圍
第三節 提高光生載流子分離效率
第四節 光催化理論研究中的計算問題
第五節 總結與展望
第七章 煤轉化過程的理論與計算
——回顧與前瞻
節 引
第二節 回顧過去、研究現狀和存在的問題
第三節 未來展望
第八章 燃燒反應機理研究進展
節 引
第二節 燃燒機理研究現狀和存在的主要問題
第三節 展望
第九章 分子間弱相互作用與自組裝理論
節 引
第二節 分子間弱相互作用與自組裝理論的發展及存在的問題
第三節展望
第四篇 材料科學中的問題
章 材料科學中的問題概述
——材料模擬對理論與計算化學的挑戰
節 結構預測對理論與計算化學的挑戰
第二節 面向材料功能預測的微觀理論
第三節 材料的生長微觀機理與動態演化
第二章 結構搜索方法
節 科學問題
第二節 穩態結構預測
第三節 過渡態結構預測
第四節 未解決的問題與展望
第三章 復合材料表界面與微孔材料的計算模擬
節 引
第二節 關鍵科學問題、解決思路、面臨的主要困難和挑戰
第三節 展望
第四章 非晶態材料理論計算領域的機遇與挑戰
節 引
第二節 非晶態材料計算發展概述
第三節 非晶態材料計算方法面臨的困難和挑戰
第四節 非晶態材料理論研究的解決方案
第五節 總結與展望
第五章 條件下的材料結構
節 概述——主要科學問題
第二節 發展歷史和現狀,解決問題的思路和面臨的主要困難和挑戰
第三節 展望未來重要發展方向和重點研究的科學問題
第六章 生長機理的理論研究:現狀與展望
節 引
第二節 晶體生長理論簡介
第三節 生長機理研究中的關鍵科學問題
第四節 總結與展望
第七章 光學材料的理論計算
節 有機發光材料的理論與計算
第二節 非線性光學材料的計算
第三節 總結與展望
第八章 電子傳輸材料的理論模擬
節 引
第二節 無機半導體電荷傳輸
第三節 有機半導體電荷傳輸
第四節 低維碳材料
第五節 分子電子學
第六節 展望
第九章 磁性材料與自旋調控
節 科學問題
第二節 理論與方法發展
第三節 磁性材料設計與自旋調控
第四節 前景與展望
第十章 新型光伏材料與熱電材料的理論模擬
節 新型光伏材料
第二節 熱電材料
第五篇 生命科學與藥物化學中的問題
章 生命科學與藥物化學中的問題概述
第二章 生物大分子的量子化學計算與分子力場
節 引
第二節 生物大分子的量子分塊計算方法
第三節 生物分子力場與極化效應
第四節 量子力學和分子力學(QM/MM)組合計算方法
第五節 展望
第三章 生物分子動力學模擬方法
節 引
第二節 分子模擬方法
第三節 蛋白質配體相互作用自由能計算
第四節 粗粒化多尺度模型
第五節 展望
第四章 生物分子中的電荷與能量轉移
節 引
第二節 電子轉移過程
第三節 質子轉移過程
第四節 質子耦合電子轉移過程
第五節 生物分子中的電荷和能量轉移發展前景展望
第五章 蛋白質結構與功能
節 引
第二節 蛋白質結構預測
第三節 金屬蛋白質
第四節 膜蛋白質
第五節 蛋白質/蛋白質相互作用
第六節 前景與展望
第六章 蛋白質設計
節 引
第二節 蛋白質設計
第三節 蛋白質結構、功能與設計發展前景展望
第七章 核酸與生物膜
節 引
第二節 核酸和蛋白質核酸相互作用
第三節 生物膜
第四節 戰略展望
第八章生物大分子信號傳導和網絡
節 引
第二節 生物分子自組裝
第三節 擁擠現象
第四節 生物分子相互作用及信號傳導
第五節 生物分子網絡
第六節 網絡藥理學
第七節 展望第九章藥物設計與開發
節 引
第二節 分子對接
第三節 打分函數
第四節 藥效團、結構活性關系
第五節 藥物治療的微觀作用機理
第六節 藥物設計中的化學信息學
第七節 藥代動力學性質和毒性預測
第八節 藥物設計新思路
附錄 關于建立“計算化學軟件平臺專項”的建議
關鍵詞索引
摘要
一、回顧理論與計算化學發展的歷程,揭示學科交叉的重要性
早期化學研究主要依靠實驗摸索和總結經驗,被看成是純實驗科學。通過不斷吸納物理學和數學的理論成果,利用計算科學發展產出的強大計算能力,構建自身的理論體系,用于化學過程以及相關領域的研究中,逐步形成理論與計算化學。學科發展歷程大致可分為四個階段。階段,以實驗探索和總結實驗事實為主,通過建立簡單理論模型說明實驗現象。第二階段,吸納物理學中熱力學和統計力學的成果,建立化學熱力學和化學統計力學。第三階段,吸納量子力學的成果,利用其概念和基本原理處理化學問題成果豐碩,極大推動了化學的發展。運用統計力學理論成果也有重要進展。第四階段,吸納計算機和計算數學成果,逐步向掌握化學變化定量規律的目標邁進;分子模擬逐漸成為研究復雜體系熱力學和動力學性質的重要工具;化學信息學也有很大進展,成為發現有指定用途化學新物質的有效途徑。
學科發展歷程表明,理論與計算化學發展的推動力首先源于化學整體向前發展的要求,理論與實驗研究伴生并行,相互促進。其次也源于理論與計算學科自身發展的需要,即發展高效率和有足夠精度的理論和計算方法。學科交叉重疊起關鍵作用:化學家不斷吸納物理學理論成果以及應用數學與計算科學成果是學科形成的實質性過程,而將理論與計算化學方法用于化學其他分支以及材料科學、生命科學、藥物學等領域的研究推動學科持續向前發展。
二、概述學科現狀、分析發展趨勢
化學進入發展的新階段,逐步發展為依靠實驗、計算、理論三方面協同工作推動的科學。理論和計算模擬方法在化學研究和相關領域中的應用日趨廣泛。理論計算與實驗工作緊密配合互動有效提高了研究效率。計算科學飛速進步使對真實復雜體系結構和運動過程的數學模擬成為可能。近年來理論與計算化學的進步主要表現在兩個方面:研究對象從簡化模型向真實復雜體系和過程逐步逼近;研究目標從對問題的定性分析走向追求定量結論。當前理論與計算化學的發展趨勢與顯現的特征是:理論分析與計算模型力求逼近復雜的真實化學體系和過程;研究重心從靜態結構逐步轉向動態過程,從簡單基元過程擴展到多種過程耦合;闡明與生命現象相關的化學過程的計算模擬成為熱點;強化對材料結構與功能關系的理論研究;對計算精度的要求進一步提高,建立新理論模型、發展高效率高精度的計算方法,成為學科本身的研究重點;重視發展能計算巨大體系和模擬復雜體系變化過程的方法;理論與計算方法在化學及相關研究中被廣泛應用,與實驗研究緊密配合互動逐步成為研究工作的常態;理論與計算研究正在逐步進入產業部門。
三、展望學科前景,指出面臨的難題
學科發展新階段——躍上新臺階的標志:在質的方面表現為科學水平的提高。理論與計算方法將具備處理更復雜實際體系和過程的能力,對計算結果的誤差有估計,對實驗結果的解釋更,指導實驗探索的作用更強。在量的方面表現為發揮作用范圍擴大,研究人員采用實驗與理論計算緊密配合互動的工作方式將成為常態。
目前存在的主要問題:研究結論沒有足夠的性,計算結果通常不能作為獨立的科學論據,只能作為佐證或者旁證。對于復雜體系的研究,結果與實驗不一致時,無法判斷是物理模型有缺陷還是數學計算的誤差。計算方面的基本困難:量子化學計算的基本矛盾是計算量和精度難于兼顧,研究化學過程對計算精度要求很高,高精度理論研究的計算量非常大;簡化計算模型和/或作計算近似,得出的結論性沒有保障。運用統計力學理論面臨兩大困難:的分子力場很難獲得,超大尺度的空間和時間模擬計算量極大,現有計算機難以勝任。發展高效率、高精度、低計算量、誤差可控(或可估計)的理論與計算方法是理論和計算化學的核心攻堅任務。
四、概述學科關鍵科學問題和學科重要研究前沿
在理論與計算化學基礎性研究方面,提出學科整體向前發展亟需解決的七個關鍵科學問題。在實際體系的理論計算研究方面,強調重視有關學科發展前沿,與實驗研究緊密配合互動開展工作;同時重視以物理學基本原理為依據,為實驗研究預測發展新方向和新領域。
對學科涵蓋的電子結構理論與計算方法、化學中的統計力學、微觀反應機理和反應動態學、材料科學中的問題、生命科學和藥物化學中的問題五個專題中各個主題的關鍵科學問題和重要前沿研究方向,在全書各章分別進行闡述和深入討論。
五、提出發展思路,建議采取相應戰略性措施
強化理論與計算化學與數學、物理、材料、生命、計算科學、信息科學等領域的交叉合作;強化理論和實驗研究的緊密結合,特別是兩者的直接配合互動;加強隊伍建設,要從國外引進高端人才,更要立足國內培養;推廣理論與計算方法在化學及相關研究中的有效運用,在普及的基礎上提高。
六、提出促進學科發展的資助機制與政策的八項具體建議
鑒于目前沒有一個公共計算化學軟件平臺嚴重影響我國理論與計算化學發展速度,項目組提出《關于建立“計算化學軟件平臺專項”的建議》
贊爆!
還不錯
怎么都覺得像是偽劣的,如果不是這個出版社真是檔次很低,書很厚,這種膠裝的很容易就開裂了,不過每次當當打折總會有幾本讓人疑慮的書記。當然字還算是能看清楚,就是紙張非常單薄,怎么看都像是學校文印店出品,而且價格死貴。當然,就事論事,當當我買書很多,好就是好,不好就是不好,但愿內容不要出問題。
正版的,不錯
速度快,整體看起來不錯~~~~~~~~~~~
內容嚴謹,對工作有幫助。